在Google Colab中学习Biopython。
你会学到什么
你将学会处理生物数据
你将学习对生物数据如DNA数据和蛋白质数据进行生物信息学计算。
您将学习Biopython的基本到高级功能。
你将学习Python编程语言在生物界的应用。
MP4 |视频:h264,1280×720 |音频:AAC,44.1 KHz,2声道
语言:英语+中英文字幕(云桥网络 机译) |时长:11节课(1小时43分钟)|大小:744.7 MB
要求
需要具备核酸、蛋白质和编程语言的基础知识。
描述
Biopython是一个处理生物数据的python库。
Biopython提供了一套工具来对生物数据(如DNA数据和蛋白质数据)进行生物信息学计算。自从我开始研究生物信息学以来,我一直使用Biopython,它的功能从未让我失望。这是一个惊人的图书馆,它提供了广泛的功能,从读取生物数据的大文件到排列序列。在本文中,我将向您介绍Biopython的一些基本功能,这些功能可以使实现变得更加容易。Python for Bioinformatics: Biopython
为了安装Biopython和运行Biopython代码,我们将使用一个名为Google Colaboratory的python web IDE。
Google Colab是深度学习任务的优秀工具。它是一款无需设置的托管Jupyter笔记本,拥有出色的免费版本,可以免费访问GPU和TPUs等谷歌计算资源。
Google Colab支持Python(截至2019年10月,仅允许创建Python 3笔记本),尽管在某些情况下,通过进一步的修补,可能有可能让R、Swift或Julia工作。
请记住,自2020年1月1日起,不再支持Python 2。
开始使用Google Colab有几种方法,我们将逐一介绍。所有的方法都很简单,这取决于你想开始做什么(比如新的笔记本或GitHub库)。
第一种方法是转到你的Google Drive账户。在左上角选择“新建”,然后在下拉面板中选择“更多”,然后选择“谷歌合作实验室”。
这门课程是给谁的
生物信息学家、程序员、药物设计师、生物化学家、生物学家。
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